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IMPROPER
-M CA N HN
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CA OXT C O
DONE
ISOLEUCINE COO- ANION
ILE
ILE INT 1
CORR OMIT DU BEG
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4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB CZ B 6 4 3 1.525 109.470 60.000 0.00000
8 CG2 C3 E 7 6 4 1.525 109.470 60.000 0.00000
9 CG1 C2 S 7 6 4 1.525 109.470 180.000 0.00000
10 CD1 CV E 9 7 6 1.525 109.470 180.000 0.00000
11 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
12 O O2 E 11 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
13 OXT O2 E 11 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CG2 CB CA CG1
CA OXT C O
DONE
VALINE
VAL
VAL INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB CZ B 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG1 C3 E 7 6 4 1.525 109.470 60.000 0.00000
9 CG2 C3 E 7 6 4 1.525 109.470 180.000 0.00000
10 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
11 O O2 E 10 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
12 OXT O2 E 10 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CG1 CB CA CG2
CA OXT C O
DONE
ASPARAGINE COO- ANION
ASN
ASN INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG C B 7 6 4 1.522 111.100 180.000 0.50000
9 OD1 O E 8 7 6 1.229 120.500 0.000 -0.50000
10 ND2 N B 8 7 6 1.335 116.600 180.000 -0.85000
11 HND1 H E 10 8 7 1.010 119.800 0.000 0.42500
12 HND2 H E 10 8 7 1.010 119.800 180.000 0.42500
13 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
14 O O2 E 13 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
15 OXT O2 E 13 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CB ND2 CG OD1
CG HND1 ND2 HND2
CA OXT C O
DONE
GLUTAMINE COO- ANION
GLN
GLN INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG C2 S 7 6 4 1.525 109.470 180.000 0.00000
9 CD C B 8 7 6 1.522 111.100 180.000 0.50000
10 OE1 O E 9 8 7 1.229 120.500 0.000 -0.50000
11 NE2 N B 9 8 7 1.335 116.600 180.000 -0.85000
12 HNE1 H E 11 9 8 1.010 119.800 0.000 0.42500
13 HNE2 H E 11 9 8 1.010 119.800 180.000 0.42500
14 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
15 O O2 E 14 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
16 OXT O2 E 14 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CG NE2 CD OE1
CD HNE1 NE2 HNE2
CA OXT C O
DONE
PHENYLALANINE, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS, COO- ANION
PHE
PHE INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.11500
8 CG CK S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 -0.11500
9 CD1 CK B 8 7 6 1.400 120.000 180.000 -0.11500
10 HD1 HK E 9 8 7 1.090 120.000 0.000 0.11500
11 CE1 CK B 9 8 7 1.400 120.000 180.000 -0.11500
12 HE1 HK E 11 9 8 1.090 120.000 180.000 0.11500
13 CZ CK B 11 9 8 1.400 120.000 0.000 -0.11500
14 HZ HK E 13 11 9 1.090 120.000 180.000 0.11500
15 CE2 CK B 13 11 9 1.400 120.000 0.000 -0.11500
16 HE2 HK E 15 13 11 1.090 120.000 180.000 0.11500
17 CD2 CK S 15 13 11 1.400 120.000 0.000 -0.11500
18 HD2 HK E 17 15 13 1.090 120.000 180.000 0.11500
14 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
15 O O2 E 14 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
16 OXT O2 E 14 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
LOOP
CG CD2
DONE
PHENYLALANINE, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS, COO- ANION
PHU
PHU INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG CA S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 0.00000
9 CD1 CD S 8 7 6 1.400 120.000 180.000 0.00000
10 CE1 CD S 9 8 7 1.400 120.000 180.000 0.00000
11 CZ CD S 10 9 8 1.400 120.000 0.000 0.00000
12 CE2 CD S 11 10 9 1.400 120.000 0.000 0.00000
13 CD2 CD E 12 11 10 1.400 120.000 0.000 0.00000
14 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
15 O O2 E 14 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
16 OXT O2 E 14 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
LOOP
CG CD2
DONE
TYROSINE, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS, COO- ANION
TYR
TYR INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.11500
8 CG CK S 7 6 4 1.510 109.470 180.000 -0.11500
9 CD1 CK B 8 7 6 1.400 120.000 180.000 -0.11500
10 HD1 HK E 9 8 7 1.090 120.000 0.000 0.11500
11 CE1 CK B 9 8 7 1.400 120.000 180.000 -0.11500
12 HE1 HK E 11 9 8 1.090 120.000 180.000 0.11500
13 CZ CK B 11 9 8 1.400 120.000 0.000 0.15000
14 OH OH S 13 11 9 1.360 120.000 180.000 -0.58500
15 HOH HO E 14 13 11 0.960 113.000 0.000 0.43500
16 CE2 CK B 13 11 9 1.400 120.000 0.000 -0.11500
17 HE2 HK E 16 13 11 1.090 120.000 180.000 0.11500
18 CD2 CK S 16 13 11 1.400 120.000 0.000 -0.11500
19 HD2 HK E 18 16 13 1.090 120.000 180.000 0.11500
20 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
21 O O2 E 20 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
22 OXT O2 E 20 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
LOOP
CG CD2
DONE
TYROSINE, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS, COO- ANION
TYU
TYU INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG CA S 7 6 4 1.510 109.470 180.000 0.00000
9 CD1 CD S 8 7 6 1.400 120.000 180.000 0.00000
10 CE1 CD S 9 8 7 1.400 120.000 180.000 0.00000
11 CZ CA B 10 9 8 1.400 120.000 0.000 0.26500
12 OH OH S 11 10 9 1.360 120.000 180.000 -0.70000
13 HOH HO E 12 11 10 0.960 113.000 0.000 0.43500
14 CE2 CD S 11 10 9 1.400 120.000 0.000 0.00000
15 CD2 CD E 14 11 10 1.400 120.000 0.000 0.00000
16 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
17 O O2 E 16 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
18 OXT O2 E 16 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
LOOP
CG CD2
DONE
GLUTAMIC ACID COO- ANION
GLU
GLU INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG C2 S 7 6 4 1.510 109.470 180.000 -0.10000
9 CD C B 8 7 6 1.527 109.470 180.000 0.70000
10 OE1 O2 E 9 8 7 1.260 117.200 90.000 -0.80000
11 OE2 O2 E 9 8 7 1.260 117.200 270.000 -0.80000
12 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
13 O O2 E 12 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
14 OXT O2 E 12 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CG OE1 CD OE2
CA OXT C O
DONE
ASPARTIC ACID COO- ANION
ASP
ASP INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 -0.10000
8 CG C B 7 6 4 1.527 109.470 180.000 0.70000
9 OD1 O2 E 8 7 6 1.260 117.200 90.000 -0.80000
10 OD2 O2 E 8 7 6 1.260 117.200 270.000 -0.80000
11 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
12 O O2 E 11 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
13 OXT O2 E 11 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CB OD1 CG OD2
CA OXT C O
DONE
LYSINE COO- ANION
LYS
LYS INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG C2 S 7 6 4 1.525 109.470 180.000 0.00000
9 CD C2 S 8 7 6 1.525 109.470 180.000 0.00000
10 CE C2 S 9 8 7 1.525 109.470 180.000 0.31000
11 NZ N3 3 10 9 8 1.470 109.470 180.000 -0.30000
12 HNZ1 H3 E 11 10 9 1.010 109.470 60.000 0.33000
13 HNZ2 H3 E 11 10 9 1.010 109.470 180.000 0.33000
14 HNZ3 H3 E 11 10 9 1.010 109.470 300.000 0.33000
15 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
16 O O2 E 15 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
17 OXT O2 E 15 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
DONE
PROLINE COO- ANION
PRO
PRO INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.337 117.000 180.000 -0.57000
5 CD CQ S 4 3 2 1.458 126.100 356.100 0.28500
6 CG C2 S 5 4 3 1.500 103.200 200.100 0.00000
7 CB C2 E 6 5 4 1.510 106.000 338.300 0.00000
8 CA CH M 4 3 2 1.451 120.600 175.200 0.18500
9 C C M 8 4 3 1.522 111.100 0.000 0.70000
10 O O2 E 9 8 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
11 OXT O2 E 9 8 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
CB CA N C
-M CA N CD
CA OXT C O
LOOP
CB CA
DONE
CYSTEINE COO- ANION
CYS
CYS INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.18000
8 SG SH S 7 6 4 1.810 116.000 180.000 -0.45000
9 HG HS E 8 7 6 1.330 96.000 180.000 0.27000
10 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
11 O O2 E 10 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
12 OXT O2 E 10 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
DONE
CYSTINE(S-S BRIDGE) COO- ANION
CYX
CYX INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB CQ S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.30000
8 SG S E 7 6 4 1.810 116.000 180.000 -0.30000
9 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
10 O O2 E 9 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
11 OXT O2 E 9 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
DONE
METHIONINE COO- ANION
MET
MET INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG CQ S 7 6 4 1.525 109.470 180.000 0.23500
9 SD S S 8 7 6 1.810 110.000 180.000 -0.47000
10 CE CW E 9 8 7 1.780 100.000 180.000 0.23500
11 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
12 O O2 E 11 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
13 OXT O2 E 11 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
DONE
ARGININE COO- ANION
ARG
ARG INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG C2 S 7 6 4 1.525 109.470 180.000 0.08000
9 CD C2 S 8 7 6 1.525 109.470 180.000 0.30000
10 NE N2 B 9 8 7 1.480 111.000 180.000 -0.70000
11 HNE H3 E 10 9 8 1.010 118.500 0.000 0.44000
12 CZ C B 10 9 8 1.330 123.000 180.000 0.64000
13 NH1 N2 B 12 10 9 1.330 122.000 0.000 -0.80000
14 HN11 H3 E 13 12 10 1.010 119.800 0.000 0.46000
15 HN12 H3 E 13 12 10 1.010 119.800 180.000 0.46000
16 NH2 N2 B 12 10 9 1.330 118.000 180.000 -0.80000
17 HN21 H3 E 16 12 10 1.010 119.800 0.000 0.46000
18 HN22 H3 E 16 12 10 1.010 119.800 180.000 0.46000
19 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
20 O O2 E 19 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
21 OXT O2 E 19 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
NE NH1 CZ NH2
CA OXT C O
DONE
HISTIDINE DELTAH COO- ANION, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS
HID
HID INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.11500
8 CG CK S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 0.01500
9 ND1 NA B 8 7 6 1.390 122.000 180.000 -0.57000
10 HND H E 9 8 7 1.010 126.000 0.000 0.42000
11 CE1 CK B 9 8 7 1.320 108.000 180.000 0.29500
12 HE HK E 11 9 8 1.090 120.000 180.000 0.11500
13 NE2 NB S 11 9 8 1.310 109.000 0.000 -0.49000
14 CD2 CK S 13 11 9 1.360 110.000 0.000 -0.01500
15 HD HK E 14 13 11 1.090 120.000 180.000 0.11500
16 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
17 O O2 E 16 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
18 OXT O2 E 16 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
CG CE1 ND1 HND
LOOP
CG CD2
DONE
HISTIDINE EPSILONH COO- ANION, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS
HIE
HIE INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.11500
8 CG CK S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 -0.01500
9 ND1 NB S 8 7 6 1.390 122.000 180.000 -0.49000
10 CE1 CK B 9 8 7 1.320 108.000 180.000 0.29500
11 HE HK E 10 9 8 1.090 120.000 180.000 0.11500
12 NE2 NA B 10 9 8 1.310 109.000 0.000 -0.57000
13 HNE H E 12 10 9 1.010 125.000 180.000 0.42000
14 CD2 CK S 12 10 9 1.360 110.000 0.000 0.01500
15 HD HK E 14 12 10 1.090 120.000 180.000 0.11500
16 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
17 O O2 E 16 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
18 OXT O2 E 16 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
CE1 CD2 NE2 HNE
LOOP
CG CD2
DONE
HISTIDINE PLUS ZWITTERION, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS
HIP
HIP INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.11500
8 CG CK S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 0.21500
9 ND1 NA B 8 7 6 1.390 122.000 180.000 -0.54000
10 HND H E 9 8 7 1.010 126.000 0.000 0.46000
11 CE1 CK B 9 8 7 1.320 108.000 180.000 0.38500
12 HE HK E 11 9 8 1.090 120.000 180.000 0.11500
13 NE2 NA B 11 9 8 1.310 109.000 0.000 -0.54000
14 HNE H E 13 11 9 1.010 125.000 180.000 0.46000
15 CD2 CK S 13 11 9 1.360 110.000 0.000 0.21500
16 HD HK E 15 13 11 1.090 120.000 180.000 0.11500
17 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
18 O O E 17 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
19 OXT O E 17 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
CG CE1 ND1 HND
CE1 CD2 NE2 HNE
LOOP
CG CD2
DONE
TRYPTOPHAN COO- ANION, ALL ATOM AROMATIC PARAMETERS
TRP
TRP INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.11500
8 CG CK S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 -0.17000
9 CD1 CK B 8 7 6 1.340 127.000 180.000 0.01500
10 HD HK E 9 8 7 1.090 120.000 0.000 0.11500
11 NE1 NA B 9 8 7 1.430 107.000 180.000 -0.57000
12 HNE H E 11 9 8 1.010 125.500 180.000 0.42000
13 CE2 CN S 11 9 8 1.310 109.000 0.000 0.13000
14 CZ2 CK B 13 11 9 1.400 128.000 180.000 -0.11500
15 HZ1 HK E 14 13 11 1.090 120.000 0.000 0.11500
16 CH2 CK B 14 13 11 1.390 116.000 180.000 -0.11500
17 HH HK E 16 14 13 1.090 120.000 180.000 0.11500
18 CZ3 CK B 16 14 13 1.350 121.000 0.000 -0.11500
19 HZ2 HK E 18 16 14 1.090 120.000 180.000 0.11500
20 CE3 CK B 18 16 14 1.410 122.000 0.000 -0.11500
21 HE HK E 20 18 16 1.090 120.000 180.000 0.11500
22 CD2 CB E 20 18 16 1.400 117.000 0.000 -0.05500
23 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
24 O O2 E 23 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
25 OXT O2 E 23 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
CD1 CE2 NE1 HNE
CE2 CH2 CZ2 HZ1
CZ2 CZ3 CH2 HH
CH2 CE3 CZ3 HZ2
CZ3 CD2 CE3 HE
LOOP
CG CD2
CE2 CD2
DONE
HISTIDINE DELTAH COO- ANION, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS
HDU
HDU INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG CC S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 0.13000
9 ND1 NA B 8 7 6 1.390 122.000 180.000 -0.57000
10 HND H E 9 8 7 1.010 126.000 0.000 0.42000
11 CE1 CP S 9 8 7 1.320 108.000 180.000 0.41000
12 NE2 NB S 11 9 8 1.310 109.000 0.000 -0.49000
13 CD2 CF E 12 11 9 1.360 110.000 0.000 0.10000
14 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
15 O O2 E 14 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
16 OXT O2 E 14 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
LOOP
CG CD2
DONE
HISTIDINE EPSILONH COO- ANION, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS
HEU
HEU INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG CC S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 0.10000
9 ND1 NB S 8 7 6 1.390 122.000 180.000 -0.49000
10 CE1 CP S 9 8 7 1.320 108.000 180.000 0.41000
11 NE2 NA B 10 9 8 1.310 109.000 0.000 -0.57000
12 HNE H E 11 10 9 1.010 125.000 180.000 0.42000
13 CD2 CG E 11 10 9 1.360 110.000 0.000 0.13000
14 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
15 O O2 E 14 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
16 OXT O2 E 14 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
LOOP
CG CD2
DONE
HISTIDINE PLUS ZWITTERION, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS
HPU
HPU INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG CC S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 0.33000
9 ND1 NA B 8 7 6 1.390 122.000 180.000 -0.54000
10 HND H E 9 8 7 1.010 126.000 0.000 0.46000
11 CE1 CP S 9 8 7 1.320 108.000 180.000 0.50000
12 NE2 NA B 11 9 8 1.310 109.000 0.000 -0.54000
13 HNE H E 12 11 9 1.010 125.000 180.000 0.46000
14 CD2 CG E 12 11 9 1.360 110.000 0.000 0.33000
15 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
16 O O E 15 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
17 OXT O E 15 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
LOOP
CG CD2
DONE
TRYPTOPHAN COO- ANION, UNITED ATOM AROMATIC PARAMETERS
TRU
TRU INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 N N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CA CH M 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.10000
7 CB C2 S 6 4 3 1.525 111.100 60.000 0.00000
8 CG C* S 7 6 4 1.510 115.000 180.000 -0.05500
9 CD1 CG S 8 7 6 1.340 127.000 180.000 0.13000
10 NE1 NA B 9 8 7 1.430 107.000 180.000 -0.57000
11 HNE H E 10 9 8 1.010 125.500 180.000 0.42000
12 CE2 CN S 10 9 8 1.310 109.000 0.000 0.13000
13 CZ2 CD S 12 10 9 1.400 128.000 180.000 0.00000
14 CH2 CD S 13 12 10 1.390 116.000 180.000 0.00000
15 CZ3 CD S 14 13 12 1.350 121.000 0.000 0.00000
16 CE3 CD S 15 14 13 1.410 122.000 0.000 0.00000
17 CD2 CB E 16 15 14 1.400 117.000 0.000 -0.05500
18 C C M 6 4 3 1.522 111.100 180.000 0.70000
19 O O2 E 18 6 4 1.229 120.500 0.000 -0.80000
20 OXT O2 E 18 6 4 1.229 120.500 180.000 -0.80000
IMPROPER
-M CA N HN
CB CA N C
CA OXT C O
LOOP
CG CD2
CE2 CD2
DONE
TERMINAL METHYL AMIDE, OPLS MODEL
AME
AME INT 1
CORR OMIT DU BEG
0.00000
1 DUMM DU M 0 -1 -2 0.000 0.000 0.000 0.00000
2 DUMM DU M 1 0 -1 1.449 0.000 0.000 0.00000
3 DUMM DU M 2 1 0 1.522 111.100 0.000 0.00000
4 NT N M 3 2 1 1.335 116.600 180.000 -0.57000
5 HN H E 4 3 2 1.010 119.800 0.000 0.37000
6 CT CW E 4 3 2 1.449 121.900 180.000 0.20000
DONE
STOP
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